Si estoy entendiendo correctamente, quieres que un script genere archivos dentro de data/pages
, y quieres que estos archivos aparezcan en el directorio y se vean con un formato que no es el de DokuWiki?
Esto lo puedes hacer en dos pasos pero lo más probable es que sólo te puedo ayudar con el primero. Instala el plugin indexmenu. Crea en dokuwiki una página llamémosla misscripts
con el siguiente contenido:
{{indexmenu>.scripts:#1}}
Esto convierte la página en un índice autogenerado para todos los artículos que vayan dentro del manespace scripts:
.
Lo único que tienes que hacer es que tu script suba los archivos necesarios a data/pages/scripts/
, y luego corres el searchindexer para actualizar la lista de archivos que indexmenu verá.
En cuanto al formato si me puedes aclarar un poco más tal vez se me ocurra algo.