nikannin, это не дублирующая строчка, это нормальное (по умолчанию) для «Докувики» отображение пространств имён (папок) и страниц (файлов).
Плагин Indexmenu скорее всего вам подойдёт.
Navi попроще в использовании будет, но предполагает ручное добавление ссылок в своё меню.