J'ai posé la question sur la liste de diffusion et il n'existe pas de solution clé en main pour faire une distribution de moins de 1 mega de dokuwiki.
Les réponses que j'ai eu serait :
1/ Utiliser PmWiki en supprimant la documentation (environ 400ko)
2/ Utiliser un hébergement avec plus de stockage (les espaces de stockage ne sont pas si cher, le temps consacré à optimiser une "petite " distribution de DokuWiki l'ai !)
En espérant que cela pourra vous aider.
Un petit lien sur une distrib (minima) mais seulement 5 mega à mini :
http://janhoo.net/blog/20090203_dokuwiki_sprachen_loeschen